1781 m. prancūzų mokslininkas prof. J. E. Gilibert (1741-1814) surinko Lietuvos floros herbaro
kolekciją, sudariusią pradžią Vilniaus herbariumui. 1823 m. Vilniaus universitete, įsteigus
Botanikos kabinetą, herbariumui suteiktas indeksas „WI“. 1832 m.Vilniaus universitetas buvo
uždarytas ir herbariumo kolekcijos išsklaidytos. Žinoma, kad J.E.Giliberto Lietuvos floros
kolecija pateko į šv. Vladimiro universitetą Kijeve. Galutinai herbariumas buvo uždarytas1842
m. Nuo 1920 m. iki 1939 m. Vilniuje Stepono Batoro universitete vėl pradėjo veikti
herbariumas. 1922 m. Kaune prof. Konstantinas Regelis įkūrė Vytauto Didžiojo universiteto
herbariumą, iš kurio 1940 m. apie 10 000 herbariuminių lapų perkelta į atkurtą Vilniaus
universiteto herbariumą.